El Programa pretende contribuir a la formación de docentes que laboran en la Educación Superior, Media y Elemental y de investigadores de posgrado, especialmente en sus dos Áreas de Concentración (Bíblica y Sistemática-Pastoral).
Además, tiene como objetivo formar, para una actuación más cualificada, asesores, pastores y líderes religiosos en instituciones y organizaciones orientadas al diálogo entre la experiencia religiosa, la fe cristiana, la sociedad y la cultura actual, teniendo como eje rector una visión humanista , capaz de expresarse a través del compromiso ético-social, el uso sostenible de los recursos naturales y la consolidación de una sociedad democrática.
Otra característica del egresado del Programa es la apertura al diálogo inter / multi / transdisciplinario, ecuménico e interreligioso, a través de una comprensión profunda de las dinámicas inherentes a la existencia humana y el compromiso público de la Teología en los debates sobre la construcción del tejido social que exigir su contribución.