El Programa pretende contribuir a la formación de profesores que trabajan en la Educación Superior, Secundaria y Básica y de investigadores de postgrado, especialmente en sus dos Áreas de Concentración (Bíblica y Sistemática-Pastoral).
También pretende formar, para una actuación más cualificada, a asesores, pastores y líderes religiosos en instituciones y organismos destinados al diálogo entre la experiencia religiosa, la fe cristiana, la sociedad y la cultura actual, teniendo como eje rector una visión humanista, capaz de expresarse a través del compromiso ético y social, el uso sostenible de los recursos naturales y la consolidación de una sociedad democrática.
Otra característica del egresado del Programa es la apertura al diálogo inter/multi/transdisciplinario, ecuménico e interreligioso, a través de una comprensión profunda de las dinámicas de la existencia humana y del compromiso público de la Teología en los debates de la construcción del tejido social que exigen su contribución.